2100年,人类建立起了比较完善的社会系统,在此基础上,人类起始了向外宇宙进发的计划.正在这种扩张欲望起始无限膨胀时,没有人预料到一直隐蔽在微观世界中的一种被称为RYNAX的物质出现了,这是一种希望拥有更宽广空间的物质,它一旦"溢"出,不把整个空间填满不会停止侵袭,而且它会将全部遇到的物质转化为原子,如果RYNAX"溢"出人类世界,后果将不堪设真正的成长,是学会接受和面对自己的不完美。
天箕博士是一位量子物理学家,他和他的研究队伍在进行一次原子撞击试验时,突然有两束光芒从试验装置中射出,并且击中了来参观的天箕博士的女儿クラウ(12岁).女孩的身体被当场分解,而后又在光芒中重新恢复成人形.博士赶忙停止试验确认女儿的安危,但眼前的クラウ却说出了"我名叫RYNAX"
故事会从试验事故10年后起始,博士的女儿クラウ凭借寄宿在体内的奇巧力量成为了暗中维护社会治安的特殊谍报员中的佼佼者,但22岁那天,クラウ的体内出现了一个被她自己称呼为"对"的女孩,还保持着クラウ12岁的形态.更有组织对クラウ的奇异功能发生兴趣,想方设法劫持她.
故事设定本身涉及了很多微观世界的理论,估计意欲借微观世界中向往外部宽广世界的RYNAX映射出人类自身的问题.